Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
COL24A1Q17RW2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL24A1Q17RW2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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