Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FXNQ16595 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FXNQ16595 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FXNQ16595 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FXNQ16595 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FXNQ16595 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FXNQ16595 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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FXNQ16595 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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FXNQ16595 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FXNQ16595 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FXNQ16595 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FXNQ16595 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FXNQ16595 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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FXNQ16595 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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FXNQ16595 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FXNQ16595 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FXNQ16595 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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FXNQ16595 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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FXNQ16595 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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FXNQ16595 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FXNQ16595 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FXNQ16595 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FXNQ16595 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FXNQ16595 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FXNQ16595 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FXNQ16595 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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