Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGCBQ16585 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCBQ16585 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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