Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTRK3Q16288 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTRK3Q16288 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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