Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SF1Q15637 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SF1Q15637 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SF1Q15637 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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