Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDSNQ15517 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDSNQ15517 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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