Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB35Q15286 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB35Q15286 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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