Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPAQ15257 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPAQ15257 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPAQ15257 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPAQ15257 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPAQ15257 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms