Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRKD1Q15139 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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