Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNIP1Q15025 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNIP1Q15025 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
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