Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF1Q14162 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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