Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL4A6Q14031 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
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COL4A6Q14031 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL4A6Q14031 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
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COL4A6Q14031 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL4A6Q14031 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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COL4A6Q14031 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
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COL4A6Q14031 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL4A6Q14031 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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COL4A6Q14031 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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COL4A6Q14031 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COL4A6Q14031 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL4A6Q14031 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COL4A6Q14031 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL4A6Q14031 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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