Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALCAMQ13740 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALCAMQ13740 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms