Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR4Q13639 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR4Q13639 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms