Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF5Q13568 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF5Q13568 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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