Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGB3BPQ13352 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGB3BPQ13352 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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