Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLF1Q13351 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF1Q13351 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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