Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CPOX-203ENST00000512905 593 ntTSL 55.97□□□□□ -1.451e-9■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 UROS-209ENST00000470483 777 ntTSL 217.45■□□□□ 0.383e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 UROS-210ENST00000484541 857 ntTSL 316.99■□□□□ 0.313e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 UROS-208ENST00000465577 721 ntTSL 516.23■□□□□ 0.193e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 UROS-212ENST00000622016 563 ntTSL 58.21□□□□□ -1.13e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 UROS-211ENST00000616800 441 ntTSL 53.11□□□□□ -1.913e-7■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.252e-6■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 KEAP1-210ENST00000592478 1044 ntTSL 1 (best)18.8■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 RPL32-203ENST00000396957 1749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.542e-38■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 RPL32-201ENST00000273223 567 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.592e-38■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 RPL32-204ENST00000429711 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.622e-38■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 PSMB6-204ENST00000575643 666 ntTSL 216.06■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 PKN1-215ENST00000592960 677 ntTSL 318.26■□□□□ 0.517e-8■■■■□ 22.2
PABPC4Q13310 ZC3H18-205ENST00000564341 387 ntTSL 516.9■□□□□ 0.39e-9■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 BCAT1-204ENST00000538118 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.614e-12■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-9■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-9■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.382e-9■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.312e-13■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 MTFP1-205ENST00000614920 648 ntTSL 223.06■■□□□ 1.282e-13■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.922e-13■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 LAMTOR2-205ENST00000487106 623 ntTSL 219.64■□□□□ 0.739e-11■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 WT1-202ENST00000379077 3032 ntTSL 1 (best)19.43■□□□□ 0.72e-13■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.672e-13■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.562e-13■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.542e-13■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 STX10-211ENST00000593126 713 ntTSL 315.37■□□□□ 0.052e-13■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.059e-11■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 LAMTOR2-201ENST00000368302 587 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.359e-11■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 LAMTOR2-202ENST00000368304 521 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.379e-11■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.822e-13■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 LAMTOR2-204ENST00000463371 462 ntTSL 37.34□□□□□ -1.239e-11■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 EIF4EBP1-202ENST00000520657 695 ntTSL 313.14□□□□□ -0.318e-9■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.162e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.222e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.152e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 SAE1-207ENST00000596995 2106 ntTSL 221.16■□□□□ 0.982e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 SAE1-204ENST00000414294 2211 ntTSL 221.15■□□□□ 0.982e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.52e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 328.22■■■□□ 2.111e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 527.77■■■□□ 2.041e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 CD320-203ENST00000596002 1729 ntTSL 1 (best)22.09■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.012e-6■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 CARS-209ENST00000470221 2466 ntTSL 219.97■□□□□ 0.796e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 CARS-208ENST00000466442 2671 ntTSL 219.31■□□□□ 0.686e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.446e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.056e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.196e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.276e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 CARS-212ENST00000526890 5732 ntTSL 212.64□□□□□ -0.396e-7■■■■□ 22.1
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PABPC4Q13310 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 22.1
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PABPC4Q13310 PVT1-211ENST00000521600 408 ntTSL 24.46□□□□□ -1.71e-6■■■■□ 22.1
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PABPC4Q13310 GTF3C5-210ENST00000489842 696 ntTSL 211.04□□□□□ -0.644e-6■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 TWISTNB-201ENST00000222567 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 RAB13-201ENST00000368575 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.34e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 RAB13-202ENST00000462680 2123 ntTSL 211.9□□□□□ -0.54e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 RAB13-204ENST00000495720 868 ntTSL 511.78□□□□□ -0.524e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 RAB13-205ENST00000614713 1353 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.844e-7■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ATP5D-208ENST00000592624 1587 nt22.54■■□□□ 1.25e-9■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.832e-9■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 MRPL24-206ENST00000478899 560 ntTSL 29.21□□□□□ -0.949e-9■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.113e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 MARVELD1-203ENST00000434038 690 ntTSL 324.33■■□□□ 1.493e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 RCCD1-205ENST00000556333 735 ntTSL 1 (best)23.88■■□□□ 1.413e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-219ENST00000636033 1940 ntTSL 523.61■■□□□ 1.373e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.253e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.053e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.933e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-216ENST00000635944 1960 ntTSL 520.16■□□□□ 0.823e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-252ENST00000637603 579 ntTSL 420.14■□□□□ 0.813e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-215ENST00000635769 575 ntTSL 419.94■□□□□ 0.783e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-239ENST00000636920 1989 ntTSL 519.77■□□□□ 0.763e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-244ENST00000637202 1634 ntTSL 519.72■□□□□ 0.753e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-212ENST00000523593 586 ntTSL 519.58■□□□□ 0.723e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-205ENST00000518087 918 ntTSL 519.51■□□□□ 0.713e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 RCCD1-204ENST00000555737 3157 ntTSL 1 (best)19.45■□□□□ 0.73e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-217ENST00000635998 1845 ntTSL 518.95■□□□□ 0.623e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-236ENST00000636815 1724 ntTSL 518.83■□□□□ 0.63e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.573e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.493e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-243ENST00000637095 2048 ntTSL 517.73■□□□□ 0.433e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.363e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.313e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-207ENST00000519468 746 ntTSL 316.66■□□□□ 0.263e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-228ENST00000636494 1975 ntTSL 516.6■□□□□ 0.253e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-241ENST00000637013 2649 ntTSL 516.42■□□□□ 0.223e-8■■■■□ 22.1
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 466.8 ms