Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHAF1BQ13112 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHAF1BQ13112 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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