Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM32Q13049 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM32Q13049 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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