Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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FOXC1Q12948 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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FOXC1Q12948 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXC1Q12948 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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FOXC1Q12948 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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FOXC1Q12948 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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FOXC1Q12948 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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FOXC1Q12948 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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FOXC1Q12948 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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FOXC1Q12948 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FOXC1Q12948 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FOXC1Q12948 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXC1Q12948 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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