Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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GTF3C1Q12789 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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GTF3C1Q12789 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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GTF3C1Q12789 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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GTF3C1Q12789 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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GTF3C1Q12789 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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GTF3C1Q12789 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C1Q12789 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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GTF3C1Q12789 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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GTF3C1Q12789 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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GTF3C1Q12789 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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GTF3C1Q12789 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C1Q12789 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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