Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCAPQ12770 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCAPQ12770 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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