Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LTBQ06643 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LTBQ06643 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LTBQ06643 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBQ06643 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBQ06643 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBQ06643 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBQ06643 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBQ06643 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBQ06643 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBQ06643 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LTBQ06643 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LTBQ06643 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms