Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TNP2Q05952 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms