Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPTBN1Q01082 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms