Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEX3Q00994 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms