Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM2Q00987 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM2Q00987 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms