Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC5Q00444 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms