Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNB1P98172 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNB1P98172 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms