Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IL13RA1P78552 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IL13RA1P78552 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms