Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC1P78348 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms