Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P62684 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113P62684 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms