Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRPF1P55201 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRPF1P55201 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms