Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AP2S1P53680 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2S1P53680 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms