Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COPAP53621 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPAP53621 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPAP53621 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPAP53621 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPAP53621 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms