Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOSBP53539 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOSBP53539 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOSBP53539 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOSBP53539 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOSBP53539 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOSBP53539 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOSBP53539 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOSBP53539 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOSBP53539 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOSBP53539 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOSBP53539 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms