Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2E1P51965 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms