Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
SMARCA2P51531 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SMARCA2P51531 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms