Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FNTAP49354 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FNTAP49354 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FNTAP49354 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FNTAP49354 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FNTAP49354 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FNTAP49354 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FNTAP49354 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FNTAP49354 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FNTAP49354 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FNTAP49354 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FNTAP49354 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FNTAP49354 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FNTAP49354 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FNTAP49354 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FNTAP49354 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FNTAP49354 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FNTAP49354 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms