Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI2P48788 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI2P48788 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms