Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRXP46100 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRXP46100 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATRXP46100 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATRXP46100 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATRXP46100 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATRXP46100 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms