Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3CBP42338 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PIK3CBP42338 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms