Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP8P40818 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP8P40818 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP8P40818 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP8P40818 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP8P40818 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP8P40818 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP8P40818 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP8P40818 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP8P40818 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP8P40818 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP8P40818 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP8P40818 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP8P40818 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP8P40818 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP8P40818 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP8P40818 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP8P40818 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP8P40818 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms