Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTGER4P35408 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms