Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSG3P32926 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSG3P32926 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSG3P32926 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSG3P32926 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSG3P32926 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG3P32926 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG3P32926 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG3P32926 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG3P32926 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG3P32926 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG3P32926 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSG3P32926 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DSG3P32926 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms