Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPS1P31327 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPS1P31327 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPS1P31327 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CPS1P31327 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPS1P31327 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CPS1P31327 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPS1P31327 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPS1P31327 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPS1P31327 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPS1P31327 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPS1P31327 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPS1P31327 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPS1P31327 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPS1P31327 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPS1P31327 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPS1P31327 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPS1P31327 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPS1P31327 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPS1P31327 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPS1P31327 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPS1P31327 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CPS1P31327 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPS1P31327 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPS1P31327 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPS1P31327 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPS1P31327 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPS1P31327 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPS1P31327 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CPS1P31327 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CPS1P31327 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms