Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms