Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTFRP26992 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms