Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTAFRP25105 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTAFRP25105 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms